На протяжении трех веков служба меняла свои названия – коновальная наука, ветеринарная часть, ветеринарная и военно-ветеринарная. В 1993 году она получила новое наименование – ветеринарно-санитарная служба Вооруженных Сил Российской Федерации. С 2004 года ей определили наименование Государственная ветеринарная служба России. В 2022 году служба получила статус федерального государственного ветеринарного контроля (надзора) на объектах Министерства обороны РФ.